Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB3IPQ96QF0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3IPQ96QF0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms