Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C9orf85Q96MD7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C9orf85Q96MD7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C9orf85Q96MD7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
C9orf85Q96MD7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
C9orf85Q96MD7 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
C9orf85Q96MD7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms