Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRRC1Q96M27 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRRC1Q96M27 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms