Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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C2orf48Q96LS8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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C2orf48Q96LS8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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C2orf48Q96LS8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
C2orf48Q96LS8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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