Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HIC2Q96JB3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HIC2Q96JB3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms