Protein–RNA interactions for Protein: Q96DL1

NXPE2, NXPE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE2Q96DL1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NXPE2Q96DL1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms