Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
GTF3C6Q969F1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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GTF3C6Q969F1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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GTF3C6Q969F1 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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GTF3C6Q969F1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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GTF3C6Q969F1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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GTF3C6Q969F1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
GTF3C6Q969F1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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