Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM41Q8WV44 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms