Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMYD1Q8NB12 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms