Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ANKRD42Q8N9B4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ANKRD42Q8N9B4 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms