Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TRAPPC6BQ86SZ2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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TRAPPC6BQ86SZ2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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