Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KRT28Q7Z3Y7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms