Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTF1AQ7RTS3 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms