Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
C16orf54Q6UWD8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms