Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Length 2,430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FAM208BQ5VWN6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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FAM208BQ5VWN6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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FAM208BQ5VWN6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FAM208BQ5VWN6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
FAM208BQ5VWN6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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FAM208BQ5VWN6 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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FAM208BQ5VWN6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FAM208BQ5VWN6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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