Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27BQ5VT28 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27BQ5VT28 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27BQ5VT28 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27BQ5VT28 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
FAM27BQ5VT28 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FAM27BQ5VT28 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms