Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RIF1Q5UIP0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms