Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OTUD3Q5T2D3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms