Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AMER1Q5JTC6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AMER1Q5JTC6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms