Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0S4

CYP27C1, Cytochrome P450 27C1, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27C1Q4G0S4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CYP27C1Q4G0S4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CYP27C1Q4G0S4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CYP27C1Q4G0S4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CYP27C1Q4G0S4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CYP27C1Q4G0S4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CYP27C1Q4G0S4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CYP27C1Q4G0S4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CYP27C1Q4G0S4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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