Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GEN1Q17RS7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GEN1Q17RS7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GEN1Q17RS7 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GEN1Q17RS7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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GEN1Q17RS7 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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GEN1Q17RS7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GEN1Q17RS7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GEN1Q17RS7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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