Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SYPL1Q16563 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
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