Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNAPC1Q16533 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNAPC1Q16533 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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SNAPC1Q16533 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNAPC1Q16533 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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