Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
R3HDM1Q15032 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
R3HDM1Q15032 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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