Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CHD4Q14839 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CHD4Q14839 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CHD4Q14839 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CHD4Q14839 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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CHD4Q14839 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CHD4Q14839 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CHD4Q14839 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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