Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
APOFQ13790 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
APOFQ13790 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
APOFQ13790 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms