Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDH18Q13634 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDH18Q13634 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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