Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEUROD1Q13562 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEUROD1Q13562 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms