Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MKRN4PQ13434 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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MKRN4PQ13434 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MKRN4PQ13434 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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