Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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CBX3Q13185 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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