Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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TRAF1Q13077 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF1Q13077 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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