Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTP4A2Q12974 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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PTP4A2Q12974 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTP4A2Q12974 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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