Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TWF1Q12792 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms