Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PDE4DQ08499 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PDE4DQ08499 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms