Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SRSF4Q08170 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
SRSF4Q08170 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms