Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLEQ07864 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLEQ07864 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
POLEQ07864 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
POLEQ07864 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms