Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SCN1BQ07699 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SCN1BQ07699 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SCN1BQ07699 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms