Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GRIN1Q05586 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GRIN1Q05586 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms