Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UBE3AQ05086 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UBE3AQ05086 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms