Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF8Q02556 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms