Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MS4A2Q01362 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms