Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TFAMQ00059 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TFAMQ00059 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms