Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRB1P82279 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRB1P82279 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRB1P82279 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRB1P82279 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms