Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
RPS29P62273 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
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