Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ARF3P61204 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ARF3P61204 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms