Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AQP4P55087 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
AQP4P55087 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms