Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLTCL1P53675 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTCL1P53675 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms