Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLCSP50747 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLCSP50747 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLCSP50747 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLCSP50747 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLCSP50747 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLCSP50747 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLCSP50747 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLCSP50747 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HLCSP50747 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HLCSP50747 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HLCSP50747 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HLCSP50747 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HLCSP50747 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms