Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GSK3BP49841 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms