Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PIP4K2AP48426 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms